间接代理报关是指报关企业接受进出口货物收发货人的委托，以报关企业自身(被委托人、代理人)的名义向海关办理报关业务的行为。报关企业以自己的名义报关，这时进出口货物的收发货人可能并没有进出口经营权和报关权，因此不可能成为报关人。举例来说，国内某大学委托某专业外贸企业代理进口实验设备并报关，在报关时，外贸企业只能以自己的名义来报关就属于这种状况。

根据代理报关法律行为责任承担的区别，在直接代理中，代理人代理行为的法律后果直接作用于被代理人，而在间接代理中，报关企业应当承担与进出口货物收发货人自己报关时所应当承担的相同的法律责任。

我国报关企业大都采取直接代理形式代理报关，间接代理报关只适用经营快件业务的国际货物运输代理企业。